研究人员对全世界1634 个菌株的全基因组数据进行了比较基因组学分析,揭示了 3 个与宿主密切相关的种群结构,分别为人类适应性菌株组(HAC,Human-associated Clade)、健康猪组(HPC, Healthy-pig Clade)和病猪组(DPC, Diseased-pig Clade)。研究发现,HAC组的菌株来源于9个不同的国家,说明该类型的菌株已经在全球进行传播和扩散,其中在亚洲形成3个平行进化的流行性支系(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),其中支系Ⅰ为引起了中国的两次大爆发的中国特有序列型——ST7菌株;支系Ⅱ为ST1型菌株组成,该支系的菌株携带一个与89kb高度类似的78kb的毒力岛,正在中国和越南之间传播;支系Ⅲ为新型的ST7菌株,该支系的菌株携带一个含多类抗性基因的127kb的耐药岛,目前已经在中国境内多个省份发现。支系Ⅱ、Ⅲ为本研究新鉴定的2个支系,需要引起我们高度重视。
华中农业大学食品科学技术学院研究生董星星和上海巴斯德研究所研究员晁彦杰为本论文共同第一作者。华中农业大学李锦铨研究员和浙江大学的冯晔副教授为共同通讯作者。本研究获得了国家重点研发计划,国家自然科学基金,湖北省科技创新专项,华中农业大学校自主创新基金资助。